Číslovanou ediční řadu Spisů Josefa Škvoreckého zahájilo v roce 1991 nakladatelství Odeon. Vzhledem ke svým koncepčním i ekonomickým problémům však stihlo vydat jen jeden svazek. Po tříleté odmlce se Spisů ujalo nakladatelství Ivo Železný, které vydalo 24 svazků (sv. 2-25).
Čtenářsky koncipovaná edice zahrnovala jak známé Škvoreckého texty, tak archivní "nálezy", také několik souborů autorovy esejistiky a publicistiky, ale i prozaické novinky.
V roce 2006 převzala vydávání Spisů Josefa Škvoreckého Literární akademie (sv. 26-31). V té době vznikla nová redakční rada Spisů a změnila se jejich grafická úprava. Po dvou letech však LA tuto svou aktivitu ukončila a od roku 2008 Spisy vycházejí v pražském nakladatelství Books and Cards.
Prima sezóna / Zbabělci / Konec nylonového věku
Příběhy o Líze a mladém Wertherovi a jiné povídky
Nové canterburské povídky a jiné příběhy
Neuilly a jiné příběhy
Lvíče
Dvě vraždy v mém dvojím životě
Příběh neúspěšného tenorsaxofonisty
Mirákl
Nápady čtenáře detektivek a jiné eseje
Tankový prapor
Nevysvětlitelný příběh aneb Vyprávění Questa Firma Sicula
Na tuhle bolest nejsou prášky
Krátké setkání, s vraždou
Podivný pán z Providence a jiné eseje
Příběh inženýra lidských duší 1
Příběh inženýra lidských duší 2
Setkání po letech, s vraždou
Velká povídka o Americe a malá o Kanadě
Setkání na konci éry, s vraždou
Setkání v Bílé dámě, s vraždou
Mezi dvěma světy a jiné eseje
Ráda zpívám z not a jiné eseje
Ze života české společnosti
Setkání v Praze, s vraždou
Obyčejné životy
Setkání v Torontu, s vraždou
Nataša, pícníci a jiné eseje
Zločin v šantánu a jiné filmové povídky a scénáře
Smutek poručíka Borůvky
Timeo Danaos a jiné eseje
Psaní, jazz a bláto v pásech. Dopisy Josefa Škvoreckého a Lubomíra Dorůžky z doby kultů (1950-1960)
Na shledanou v lepších časech. Dopisy Josefa Škvoreckého a Lubomíra Dorůžky z doby marnosti (1968-1989)
Hříchy pro pátera Knoxe
Pekařův kluk a jiné hry a scénáře z exilu
Zbabělci
Konec poručíka Borůvky
Nejdražší umění a jiné eseje o filmu
Návrat poručíka Borůvky
Jak je ve větě člověk. Dopisy Josefa Škvoreckého a Jana Zábrany
Nevěsta z Texasu